Adobe PDF
(4.03 MB)
| Title Details: | |
|
Βιολογικές βάσεις δεδομένων - Ανάκτηση αλληλουχιών με τη βοήθεια περιηγητών γονιδιωμάτων |
|
| Authors: |
Papanikolaou, Georgios |
| Reviewer: |
Patrinos, Georgios |
| Subject: | MEDICINE AND HEALTH SCIENCES, LIFE SCIENCES, BIOLOGICAL SCIENCES > LIFE SCIENCES > MOLECULAR BIOSCIENCES > GENETICS |
| Keywords: |
Human Genetics
|
| Description: | |
| Abstract: |
Στο θεωρητικό μέρος του κεφαλαίου παρουσιάζονται βασικοί διαδικτυακοί τόποι για την αναζήτηση πληροφοριών όπως οι ΟΜΙΜ, GeneTests, UniProt, εξηγείται η δομή και λειτουργία του International Nucleotide Sequence Database Collaboration, οι βάσεις GenBanK και RefSeq ενώ δίνεται ιδιαίτερη βαρύτητα στην παρουσίαση του περιηγητή γονιδιωμάτων (Genome Browser) του University of California, Santa Cruz (UCSC). Εξηγείται η δομή των αρχείων fasta για την αποθήκευση και επεξεργασία αλληλουχιών. Στις πρακτικές ασκήσεις πραγματοποιούνται αναζητήσεις πληροφοριών σχετικών με το γονίδιο TAS2R38 στους διαδικτυακούς τόπους και βάσεις που παρουσιάστηκαν στο θεωρητικό μέρος και εξηγείται η ανάκτηση της αλληλουχίας του γονιδίου TAS2R38 και της πρωτείνης και η ανάκτηση των αλληλουχιών ορθολόγων γονιδίων σε άλλα είδη.
|
| Table of Contents: |
Βιολογικές βάσεις δεδομένων
2.1 Θεωρητικό μέρος 2.1.1 Βιολογικές βάσεις δεδομένων 2.1.2 Γονιδιωματικές βάσεις δεδομένων 2.1.3 Η GenBank 2.1.4 H Συλλογή Αλληλουχιών Αναφοράς (RefSeq) 2.1.5 Περιηγητές γονιδιωμάτων 2.1.6 Ο περιηγητής γονιδιωμάτων του UCSC 2.1.7 Βάσεις δεδομένων μεταλλάξεων 2.1.8 Πρωτεϊνικές βάσεις δεδομένων 2.1.9 O κατάλογος OMIM (Online Mendelian Inheritence in Man) 2.1.10 GeneTests και GeneReviews 2.1.11 Μεταβολικά μονοπάτια 2.1.12 Ονόματα γονιδίων (genenames.org) 2.1.13 Δουλεύοντας στον υπολογιστή με αρχεία αλληλουχιών 2.2 Πρακτικό μέρος 2.2.1 Αναζήτηση πληροφοριών και ανάκτηση αλληλουχιών του ανθρώπινου γονιδίου TAS2R38 . 2.3 Ερωτήσεις - εργασίες 2.4 Βιβλιογραφία |
| Linguistic Editors: |
Pantos, Panagiotis |
| Type: |
Chapter |
| Creation Date: | 2015 |
| Item Details: | |
| License: |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/gr |
| Handle | http://hdl.handle.net/11419/643 |
| Bibliographic Reference: | Papanikolaou, G. (2015). Βιολογικές βάσεις δεδομένων - Ανάκτηση αλληλουχιών με τη βοήθεια περιηγητών γονιδιωμάτων [Chapter]. In Papanikolaou, G., Palaiologou, D., Katsareli, E., Katsila, T., Tsarouha, H., Tzetis, M., Lilakos, K., & Doukissas, L. 2015. Laboratory Exercises in Human Genetics [Laboratory Guide]. Kallipos, Open Academic Editions. https://hdl.handle.net/11419/643 |
| Language: |
Greek |
| Consists of: |
1. Αρχικά σχόλια μιας τυπικής εγγραφής της GenBank 2. Ρυθμίσεις προβολής σχολίων του περιηγητή UCSC. 3. Προβολή περιοχής του χρωμοσώματος 7q34 στον περιηγητή του UCSC. 4. Οι σχέσεις μεταξύ των βάσεων δεδομένων που διαχειρίζεται η κοινοπραξία UniProt. 5. Προβολή διεξαγωγής αναζητήσεων στον περιηγητή του UCSC. 6. Προβολή της σελίδας του UCSC με πληροφορίες και συνδέσμους σχετικούς με το γονίδιο TAS2R38. |
| Is Part of: |
Laboratory Exercises in Human Genetics |
| Number of pages |
23 |
| Typical Learning Time: |
PT02H00M00S |
| Publication Origin: |
Kallipos, Open Academic Editions |