Βιολογικά Δίκτυα

Abstract

Το κεφάλαιο αυτό ενσωματώνει στοιχεία από τα δύο αμέσως προηγούμενα και επικεντρώνεται στη μελέτη των βιολογικών δικτύων. Μετά από μια εισαγωγή των βασικών βιολογικών εννοιών που περιλαμβάνουν τα είδη των δικτύων (ρυθμιστικά, μεταβολικά κ.ά.) περνάει στο πραγματικό βιολογικό πρόβλημα που αφορά την εξαγωγή ενός δικτύου ρυθμιστικών αλληλεπιδράσεων πρωτεϊνών από δεδομένα γονιδιακής έκφρασης. στο πλαίσιο της συζήτησης του προβλήματος θα εισαχθούν βασικές έννοιες από τη θεωρία δικτύων (τοπολογία, βαθμός, μέγεθος δικτύου κλπ) και στη συνέχεια θα αναλυθούν οι στατιστικές ιδιότητες των βιολογικών δικτύων με έμφαση στις δομές αυτο-οργάνωσης, τα ανεξάρτητα κλίμακας (scale-free) δίκτυα και τους νόμους δύναμης. Οι πρακτικές ασκήσεις θα περιλαμβάνουν την εξαγωγή δικτύων και την ανάλυση των στατιστικών τους ιδιοτήτων.<br/><br/>Στο τέλος του Κεφαλαίου θα πρέπει να μπορείτε:<br/>Να περιγράψετε βασικά είδη βιολογικών δικτύων.<br/>Να αναγνωρίσετε τα κυριότερα μοτίβα δικτύων και τις ιδιότητές τους.<br/>Να αναλύσετε ποσοτικά τα βασικότερα χαρακτηριστικά γράφων/δικτύων.<br/>Να διακρίνετε μεταξύ τυχαίων δικτύων και δικτύων ανεξάρτητων κλίμακας.